如何用 Linux 使用 Gaussian09一

一.將 Gaussian 建立在自己的目錄底下

1.cd /work/LAB-software/g09Ver (移動到這層目錄)

 

2.cp g09-D01-V7-ieee.tgz /home/gary (複製 g09 到我的目錄)

 

3.tar -zxvf g09-D01-V7-ieee.tgz (解壓縮 g09)

 

4.ln -s g09-D01-V7-ieee g09 (將 g09-D01-V7-ieee.tgz 改成 g09)

以後輸入指令打 g09 便可代替 g09-D01-V7-ieee.tgz

 

5.vi .login

     source .login

     which g09 

 

二.將 gaussianLinux 執行

1.用 GaussView 畫出想要的分子結構(長相不能差太多,不然可能算不出來)

 

2.用 File 存檔 (save) → 將 Write Cartesians 打勾 → 副檔名 (.gjf)

 

3.用記事本將檔案打開(開啟舊檔)

 

4.複製上面的座標

 

5.用 Linus 打開一個新檔案 (vi aldehyde.com)

 

6.把座標複製上去

 

7.將其他指令設定進去 (方法,記憶體,核心)

指令 意義
%nprocshared= 計算用到幾核心 (4)
%mem= 計算用到多少記憶體 (4GB)
%chk=aldehyde.chk 計算後存檔的檔案名稱
method (ex. b3lyp/6-31+g(2d,p)) 計算方法

 

8.存檔後利用 g09 aldehyde.com & 執行計算動作 (&: 在背景執行)

 

二.簡單分子計算

1.甲醛( CH2O )

計算法

B3LYP/6-311+G(2d,p)

 

Result

 

HOMO & LUMO

HOMO

LUMO

 

2.乙烯(CH2CH2)

計算法

B3LYP/6-311+G(2d,p)

 

Result

 

HOMO & LUMO

HOMO

LUMO

 

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